菌芽孢在内的所有微生物的消毒剂。如过氧乙酸、过氧化氢、二氧化氯、含氯消毒剂
过氧乙酸：具有强氧化性，能快速杀灭各种细菌、病毒、芽孢等。常用于医院、公共场所等的环境消毒，如对病房、手术室等进行喷雾消毒，也可用于耐腐蚀医疗器械的浸泡消毒。
过氧化氢：分解产生的羟基自由基具有强氧化性，可有效杀灭细菌芽孢。一般用于伤口消毒、食品加工设备的消毒等，其分解产物为水和氧气，无污染残留。
二氧化氯：是一种强氧化剂，对细菌、病毒、芽孢等有很强的杀灭作用。在饮用水消毒、食品加工场所消毒等方面应用广泛，消毒后不产生有害物质。
含氯消毒剂：在水中能够产生次氯酸，次氯酸具有强氧化性，可使微生物的蛋白质、核酸等物质发生氧化反应，从而导致微生物死亡。它能够快速有效地杀灭包括细菌芽孢在内的各种微生物，如常见的大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、白色念珠菌，以及乙肝病毒、艾滋病病毒等，还能在短时间内破坏细菌芽孢的结构，使其失去活性。像84消毒液，其主要成分是次氯酸钠，在医院、家庭、公共场所等广泛应用，可用于物体表面、地面、织物等的消毒，能有效预防和控制传染病的传播。
中效消毒剂：能杀灭除芽孢以外的细菌繁殖体、真菌和多数病毒的消毒剂。如乙醇，碘伏，胍类消毒剂（氯己定）
乙醇：75%的乙醇能使蛋白质脱水变性，常用于皮肤消毒、体温计等医疗器械的消毒，也可用于物体表面的擦拭消毒。
碘伏：碘与表面活性剂的结合物，可缓慢释放碘，对细菌繁殖体、真菌、病毒等有较好的杀灭作用。常用于手术部位的消毒、伤口消毒等，对皮肤黏膜的刺激性较小。
胍类消毒剂：如氯己定，对细菌繁殖体有较强的杀灭作用，对病毒和芽孢的作用较弱。常作为皮肤消毒剂、口腔消毒剂等使用，具有杀菌作用持久的特点。
低效消毒剂：只能杀灭细菌繁殖体、部分真菌和亲脂病毒，不能杀